Με το υπερηχογράφημα νεφρών μπορεί να γίνει πλήρης διερεύνηση του νεφρού και να διαγνωστούν: η υδρονέφρωση, η νεφρολιθίαση, η διάταση του πυελοκαλυκικού συστήματος του νεφρού και της πυέλου, η πυελονεφρίτιδα, ο όγκος νεφρού ή του παρεγχύματος, οι κύστεις στο νεφρό, οι συγγενείς παθήσεις (πλειοκυστικός, πολυκυστικός νεφρός ) κ.α.
Με το υπερηχογράφημα κύστης μπορεί εύκολα να εντοπιστεί η ύπαρξη παθολογικών ευρημάτων και να διαγνωστεί εάν υπάρχει κατακράτηση ούρων οπότε στη συνέχεια θα ελεγχθεί σε τι μπορεί να οφείλεται η απόφραξη της ουρήθρας (λίθος, όγκος, φλεγμονή, ουρητηροκήλη κ.α)
Με τον υπέρηχο όρχεως ελέγχεται ο όρχις και το οσχέο για την ύπαρξη όγκου, επιδιδυμίδας, υδροκήλης, φλεγμονής, αποστήματος, κύστης κ.α
Με τον διακοιλιακό υπέρηχο μπορεί να διαγνωστεί η καλοήθης υπερπλασία του προστάτη αδένα και να υπολογιστεί το μέγεθος της υπερπλασίας. Να υπάρξουν επίσης ευρήματα για χρόνια φλεγμονή του προστάτη ή σε κάποιες μόνο περιπτώσεις να διαγνωστεί και ο καρκίνος του προστάτη. Τότε συμπληρωματικά, θα γίνει και διορθικό υπερηχογράφημα.
Με τον υπέρηχο πέους καί το έγχρωμο δυναμικό Doppler πέους ελέγχονται οι ανατομικές δομές του πέους, η ουρήθρα και το σπογγιώδες σώμα καθώς και οι χιτώνες που τα περιβάλλουν καθώς και πιθανές βλάβες.
Το έγχρωμο Doppler πέους χρησιμοποιείται διαγνωστικά προκειμένου να διαπιστωθεί εάν η στυτική δυσλειτουργία οφείλεται σε οργανικά αίτια καθώς εάν δεν υπάρξουν ευρήματα η διερεύνηση αφορά σε ψυχολογικά αίτια