Η διαδερμική λιθοτριψία διενεργείται μέσω μιας μικροσκοπικής τομής στην νεφρική χώρα μέσω της οποίας, υπό ακτινοσκοπικό έλεγχο, δημιουργείται ένα στενό κανάλι κατευθείαν στην αποχετευτική μοίρα του νεφρού και στο σημείο το οποίο βρίσκεται ο λίθος.
Από το κανάλι εισέρχεται υπό άμεση όραση ένα ενδοσκόπιο που ονομάζεται νεφροσκόπιο για τον έλεγχο του εσωτερικού του νεφρού. Για τον κατακερματισμό του λίθου χρησιμοποιούμε υπερήχους ή ηλεκτροϋδραυλικά κύμματα και τα τελευταία χρόνια σχεδόν πάντοτε ακτίνες laser, διότι έχουμε καλύτερα αποτελέσματα με λιγότερες ανεπιθύμητες ενέργειες.
Η πλειοψηφία των ασθενών νοσηλεύεται για μία ημέρα και μπορεί να επιστρέψει στην εργασία μετά από μία έως δύο ημέρες.